Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Slc5a6Q5U4D8 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Slc5a6Q5U4D8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms