Protein–RNA interactions for Protein: Q5TIS6

Noto, Homeobox protein notochord, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NotoQ5TIS6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NotoQ5TIS6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NotoQ5TIS6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms