Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trim38Q5SZ99 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim38Q5SZ99 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms