Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med13Q5SWW4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Med13Q5SWW4 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms