Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tsr1Q5SWD9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tsr1Q5SWD9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tsr1Q5SWD9 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.6 ms