Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW75

Ssh2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh2Q5SW75 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Ssh2Q5SW75 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ssh2Q5SW75 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Ssh2Q5SW75 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms