Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW45

Mks1, Meckel syndrome type 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mks1Q5SW45 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Mks1Q5SW45 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Mks1Q5SW45 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms