Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r195Q5SVD6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r195Q5SVD6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms