Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Bbs12Q5SUD9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Bbs12Q5SUD9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms