Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sft2d1Q5SSN7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sft2d1Q5SSN7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms