Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TefmQ5SSK3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TefmQ5SSK3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms