Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH6

Smg7, Protein SMG7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg7Q5RJH6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg7Q5RJH6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg7Q5RJH6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg7Q5RJH6 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg7Q5RJH6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg7Q5RJH6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg7Q5RJH6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg7Q5RJH6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg7Q5RJH6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg7Q5RJH6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg7Q5RJH6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg7Q5RJH6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
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