Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rtp3Q5QGU6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rtp3Q5QGU6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms