Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Hs3st6Q5GFD5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hs3st6Q5GFD5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hs3st6Q5GFD5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms