Protein–RNA interactions for Protein: Q58FA4

E2f8, Transcription factor E2F8, mousemouse

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f8Q58FA4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f8Q58FA4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f8Q58FA4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f8Q58FA4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
E2f8Q58FA4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
E2f8Q58FA4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
E2f8Q58FA4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms