Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Znf354cQ571J5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Znf354cQ571J5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms