Protein–RNA interactions for Protein: Q571I4

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q571I4 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAG1Q571I4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAG1Q571I4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAG1Q571I4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAG1Q571I4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAG1Q571I4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PRAG1Q571I4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRAG1Q571I4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRAG1Q571I4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms