Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Trappc3lQ4KL14 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Trappc3lQ4KL14 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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