Protein–RNA interactions for Protein: Q497I5

Lce3a, Late cornified envelope 3A, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lce3aQ497I5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Lce3aQ497I5 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms