Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Snx25Q3ZT31 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Snx25Q3ZT31 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms