Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZRW6

Clul1, Clusterin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clul1Q3ZRW6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Clul1Q3ZRW6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Clul1Q3ZRW6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms