Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Fam220aQ3ZN08 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Fam220aQ3ZN08 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Fam220aQ3ZN08 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Fam220aQ3ZN08 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Fam220aQ3ZN08 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Fam220aQ3ZN08 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam220aQ3ZN08 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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