Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M2

Lrrc36, Leucine-rich repeat-containing protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc36Q3V0M2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc36Q3V0M2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc36Q3V0M2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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