Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ankrd53Q3V0J4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ankrd53Q3V0J4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd53Q3V0J4 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd53Q3V0J4 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ankrd53Q3V0J4 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms