Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Usp48Q3V0C5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Usp48Q3V0C5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Usp48Q3V0C5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms