Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXZ9

Kdm5a, Lysine-specific demethylase 5A, mousemouse

Predictions only

Length 1,690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5aQ3UXZ9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Kdm5aQ3UXZ9 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Kdm5aQ3UXZ9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm5aQ3UXZ9 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms