Protein–RNA interactions for Protein: Q3UVD5

Lgr6, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 6, mousemouse

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr6Q3UVD5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lgr6Q3UVD5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lgr6Q3UVD5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms