Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Slfn4Q3UV66 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Slfn4Q3UV66 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms