Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-Eb2Q3UUV9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms