Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Skap1Q3UUV5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Skap1Q3UUV5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms