Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTY6

Thsd4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thsd4Q3UTY6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Thsd4Q3UTY6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thsd4Q3UTY6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thsd4Q3UTY6 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Thsd4Q3UTY6 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Thsd4Q3UTY6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thsd4Q3UTY6 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thsd4Q3UTY6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thsd4Q3UTY6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thsd4Q3UTY6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thsd4Q3UTY6 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thsd4Q3UTY6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Thsd4Q3UTY6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms