Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
E130208F15RikQ3UPV3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
E130208F15RikQ3UPV3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms