Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP44

Nhlrc4, NHL-repeat-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc4Q3UP44 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nhlrc4Q3UP44 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nhlrc4Q3UP44 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms