Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrc4Q3UP24 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrc4Q3UP24 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Nlrc4Q3UP24 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nlrc4Q3UP24 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nlrc4Q3UP24 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nlrc4Q3UP24 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nlrc4Q3UP24 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Nlrc4Q3UP24 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Nlrc4Q3UP24 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nlrc4Q3UP24 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms