Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Skap2Q3UND0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Skap2Q3UND0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms