Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMF0

Cobll1, Cordon-bleu protein-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cobll1Q3UMF0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cobll1Q3UMF0 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cobll1Q3UMF0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms