Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMB9

Washc4, WASH complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Washc4Q3UMB9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Washc4Q3UMB9 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Washc4Q3UMB9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Washc4Q3UMB9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 307.5 ms