Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULD5

Mccc2, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc2Q3ULD5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Mccc2Q3ULD5 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mccc2Q3ULD5 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms