Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gpr55Q3UJF0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gpr55Q3UJF0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms