Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sf3b2Q3UJB0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Sf3b2Q3UJB0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sf3b2Q3UJB0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms