Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Greb1Q3UHK3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Greb1Q3UHK3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms