Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH1

Zswim8, Zinc finger SWIM domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zswim8Q3UHH1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zswim8Q3UHH1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zswim8Q3UHH1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zswim8Q3UHH1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms