Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Pitpnm3Q3UHE1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Pitpnm3Q3UHE1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms