Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rnf180Q3U827 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf180Q3U827 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
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