Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2P1

Sec24a, Protein transport protein Sec24A, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec24aQ3U2P1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sec24aQ3U2P1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sec24aQ3U2P1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sec24aQ3U2P1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms