Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tatdn3Q3U1C6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tatdn3Q3U1C6 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tatdn3Q3U1C6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tatdn3Q3U1C6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tatdn3Q3U1C6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tatdn3Q3U1C6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.2 ms