Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ccdc174Q3U155 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc174Q3U155 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc174Q3U155 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms