Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Tmem35bQ3U0Y2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Tmem35bQ3U0Y2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms