Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trappc9Q3U0M1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trappc9Q3U0M1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trappc9Q3U0M1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms