Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0J8

Tbc1d2b, TBC1 domain family member 2B, mousemouse

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2bQ3U0J8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tbc1d2bQ3U0J8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tbc1d2bQ3U0J8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tbc1d2bQ3U0J8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms